深汕特别合作区智慧城市研究院有限公司为深汕特别区区属国有独资企业，负责编制深汕特别区智慧城市顶层规划设计，统筹城市大数据建设，实现重点起步建设区定期动态更新；技术支撑合作区城市规划、土地管理、经济发展、生态保护等管理业务，基本形成具有一定影响力的合作区发展智库。
深汕特别合作区城市建设投资发展有限公司为深汕特别区区属国有独资企业，负责统筹集体土地开发利用、促进合作区安居工程建设、集体经济发展等，重点确保起步区建设，旨在建成城市和农村经济管理与建设的协同化体系，实现全面协调可持续发展。
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